就在清軍的最后一次騎兵進攻被商家軍瓦解的同時，商家軍的總周少桓也收到了報告，知道在南城的童大勇和滕玉己經擊敗了清軍，現在童大勇也帶領著軍隊趕過來支援自己，因此周少桓也精神大振，現在終于到了全面反攻的時候了。
這時商家軍己經打掉了在清軍的陣列中，對自己最有威脅的四門紅夷火炮，因此周少桓也下令，所有的重型火炮也調整目標，對準清軍陣列后面的指揮臺開火射擊。
雖然和讬的指揮臺設在全軍的陣列最后，但同樣在商家軍的十二門重型火炮，由其是八門三寸六分口徑青銅炮的絕對射程范圍以內。
不過盡管有炮鏡和十字標準星，但在這個距離上，另外四門三寸八分口徑的鑄鐵炮的準頭比青銅炮就差得多了，但畢竟是使用的開花彈，只要大致的位置差不多就行了。而且指揮臺的目標，可比剛才的紅夷火炮要大的多。因此隨著商家軍的十二門重型火炮相繼再度發出怒吼，噴射出耀眼的火舌，在六百余步的距離以外的清軍指揮臺周圍，己被一片巨大的爆炸轟鳴聲和硝煙所包圍了。
在商家軍連續二三輪炮轟之后，淸軍陣列中以指揮臺為中點的方圓十余丈的范圍內己是一片狼藉，無一生者，而指揮臺雖然還屹立著不倒，但也被炸得支離破碎，而且己經燃起了大火，地上盡是被炸得血肉模糊清軍尸體，其中還不乏殘肢斷臂，碎甲裂盔。
而這時在商家軍的陣地上，盡管清軍的最后一次騎兵沖鋒被打散，但后面的步軍也借著騎兵沖鋒嬴得的一線時間，沖到了商家軍的戰壕，而商家軍的戰兵們也都插好了刺刀，紛紛跳出了戰壕，和清軍展開了白刃格斗。雙方人來我往，打得十分激烈。
不過這時童大勇也帶著人馬趕到了戰場，從清軍的側翼沖殺了過來。盡管清軍也十分頑強，但畢竟人數不足，而且又是被商家軍兩線夾擊，終于還是抵抗不住，被殺的連連敗退。而在淸軍的主陣中，指揮臺遭到炮擊，主將和讬當場被炸死的結果也讓其他幸存的清兵軍心大動，根本就無心再戰下去，因此也都扔下武器，轉身逃走。清軍終于潰敗了下去。
周少桓和童大勇在陣前合兵之后，也立刻乘著勝勢展開了追擊，一口氣又追殺出了近二十里路，也殺死活捉了不少清軍，這才止住了腳步，收兵回到青州。
這一仗商家軍兩線作戰，均取得了勝利，共計消滅清軍八千余人，并且在城北戰場的指揮臺上，發現了一俱清軍將官的尸體，雖然爆炸和大火己經把尸身弄得面目全非，但經過了俘虜的辨認證實，這是清軍的主將、鑲紅旗梅勒章京和讬的衣甲。而從其他尸體中，還發現了有三名甲喇、八名牛錄，和九十二名白甲兵的尸體。
另外這一戰還生擒清軍八百零七人，奪得戰馬二百三十七匹。其他刀槍旗幟多達萬余件。俘虜和戰利品到是都不多，因為大部份清兵和戰馬都被打死了。
而商家軍自身也戰死了三百八十七人，受傷的多達七百一十二人，傷亡的士兵主要是來自北城的戰場。當然戰果也大部份都是在這里取得。
之所以在這一戰中殺死清軍的中層將領的比例很高，主耍原因也是因為商家軍陪養了一批的狙擊手，在戰場上都盯準了將領射擊。當然獵人步槍的作用也是功不可沒的。而且不僅僅是獵人步槍，還有雷霆戰車、青銅火炮、手榴彈，甚致是望遠鏡、炮鏡等等都發揮了巨大的作用。可以說沒有如果沒有這些武器，商家軍根本不可能取得這一次戰爭的勝利。
和兩年之前相比，商家軍使用的武器幾乎又完成了一次全面的升級換代，而這一戰中，商家軍的新武器也幾乎都得到了一次全面的檢驗，同時也在一次證明，同清軍相比，商家軍在武器上的優勢地位十分明顯，幾乎就是兩個不同的時代。
戰爭結束之后，童大勇率軍返回穆陵關駐守，仍然在臨朐縣留下了一個營，隨時都可以支援青州。而周少桓依然在青州駐守，同時也把獲勝的消息傳回登州，并且將一部份俘虜解押上船，送到杭州交給商毅處理。
清軍的敗軍逃回了臨川縣之后，雙方合兵，竟己不足萬人，主將和讬陣亡。而且在出征時滿八旗兵是二千五百余，這時己不足七百。可以說是一場慘敗。
不過和讬陣亡之后，全軍以李率泰的官職最高，而且他又是這一次出兵山東的副將，因此也暫時代理全軍主將。李率泰在南城雖然也敗了，但他的人馬中損失的主要是降軍，自己的漢軍傷亡并不算大，但萬萬沒有想到，北城竟然會比自己敗得還要慘得多。雖然說自己是全身而退，在戰場上保全的性命，但怎么去向多爾袞交待呢？
想到暴怒狀態下的多爾袞，李率泰也不禁覺得不寒而立，心里反到有些羨慕起和讬來，這家伙一死百了，什么事都不用管了，但卻留給自己一個大亂攤孑，應怎么收拾呢？
雖然是這樣想，但李率泰還是要付起暫時主將的責任，臨川縣肯定是不敢再留了，因些李率泰下令，放棄臨州縣，撤回到濟南駐守，四門緊閉，吊橋高扯，又準備了大量滾木擂石，以防商家軍來進攻濟南。同時又向北京報告了這一戰的經過，發去了告急文書。
雖然商家軍沒有乘勝來進攻濟南，但獲勝的消息很快就傳開，也再一次震驚了整個山東省，因為這一次清軍可不再是上一回王鰲永、方大猷帶來的烏合之眾，而是正宗的滿漢八旗精銳，可以算兵強馬壯，結果又一次被商家軍打得大敗，損兵折將不說，就連主將都陣亡當場。可以說這是商家軍繼一年半以前在山東大敗清軍之后，又一次全面的勝利。
同時因為清軍的到來而暫時平息下去的各地反叛力量也都在蠢蠢欲動，山東巡撫方大猷剛剛過了兩天的舒心曰子，這一下又懸了起來。
終于在七月十五曰，多爾袞的使者也來到了濟南，同時也帶來了三千援軍，使者向他們傳達多爾袞的命令，首先狠狠的把李率泰訓訴了一頓，然后命李率泰、額孟格立刻返回北京聽候處置，其他的兵將人馬都暫交由柯永盛統領，由方大猷節制，一定要守住濟南。
接到了多爾袞的命令之后，李率泰也只得向柯永盛移交了兵權，然后和額孟格一起，硬著頭皮返回北京，而柯永盛和方大猷雖然不用去面對盛怒的多爾袞，但同樣也是提心吊膽，只能禱告老天爺，商家軍可千萬不要來攻打濟南。
而就在這同時，青州大捷的消息和清軍的俘虜、戰利品也都隨著移民臺灣的船隊，送到了杭州。
商毅接報之后，也十分高興，看來周少桓到是不枉自己苦心陪養了一番，現在確實能夠獨當一面了。而且這一戰之后，山東戰區的局面也可以初步穩定下來了。清軍想派來第二批人馬，恐怕還要再等上一段時間。
隨后商毅又把這次勝利寫成了捷報，連同這些俘虜、戰利品一起送到南京，去向朱由崧報捷宣功。同時也在［杭州時報］上大張旗鼓的宣傳。
現在［杭州時報］每期的發行量己經達到了五千份，影響力也遍及整個浙江及周邊地區，也包括南京。盡管還沒有在南京城中公開發行，但在南京城外，卻己設立了兩個發行點，每期都各有三百份［杭州時報］在這里發行，一些人都專程出城來購買，通過看報來了解一些朝廷的時事。
雖然一些朝廷官員對［杭州時報］頗為不滿，認為有傷風化，但誰都知道，現在朝廷根本管不住商毅，而且這時馬黨、東林黨兩派都忙著內斗，這件小事誰也顧不上。
因此青州大捷的捷報傳到南京的時候，［杭州時報］也率先把這個消息公布了出來。結果這一次又在南京引起了一場大轟動，不僅是因為戰果巨大，而且還送來了俘虜和戰利品。在押送俘虜、戰利品進城的時候，也引得許多百姓在街邊圍觀，雖然百姓們分不清戰利品的盔甲旗幟等級，但清軍的俘虜卻是可以看得出來，純正的滿人和漢人還是有十分明顯的區分的。
結果這次捷報在南京城中又引發了一場軒然大波，一批中下層官員，還有一些東林黨人以及復社等一批仕士夫們都紛紛上書朝廷，要求南京朝廷趁著這次青州大捷，立刻出兵收復中原的土地，把清軍趕出關外去。
也弄得南京朝廷十分尷尬，因為這時南京朝己經做出決定，派造左懋第、陳洪范、馬紹愉三人為核心，組成北使團。準備北上前往北京謁陵，祭告先帝；通謝清王，并酬謝剿寇文武勞勛，同時還有“大明皇帝致書北國可汗”的御書、以及封吳三桂為“薊國公”的誥敕。而在松山降清的總兵祖大壽的兒子錦衣衛指揮祖澤傅也隨團北行。
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