仗打到這個份上，日本人的選擇已經不多了，哪怕是對皇國的前景無比看好，認為所謂皇軍決不可戰勝的死硬軍國主義份子也不得不承認，僅靠山口多聞的飛龍號和近藤信竹的瑞風號根本不是美畜兩艘大型航母的對手。≤，
在這里必須多說一句，日本人的情報工作真心是相當的混亂，近藤信竹始終沒有意識到他攻擊的目標和南云忠一攻擊的目標是完全不同的兩個目標。近藤信竹以為自己正在和南云忠一一起夾擊敵人，所以他認為自己攻擊的那兩艘航空母艦是美國的大黃蜂號和企業號。
另一邊，南云忠一因為赤城號被摧毀時棄船脫離了指揮，也沒有意識到近藤信竹的錯誤。至于山口多聞，這位老哥的就是復仇，就是決心反擊，根本沒工夫關注其他的事情，自然也沒有管近藤信竹的破事。
所以當亂七八糟的情報反饋到大和號上時，山本五十六極其參謀對戰場上的情況發生了誤判，以為戰場上只存在三艘美國航母，而且其中一艘已經被重創，并沒有意識到盟軍實際中還擁有四艘尚能一戰的大型航母。
當然，前面也說了，山本五十六雖然不愿意承認，但也必須接受這樣的現實——在中途島周邊，皇軍的兵力太單薄，不是美畜的對手。如果想要翻盤就必須加大投入。
怎么加大投入呢？山本五十六的參謀黑島龜人就立刻建議，將北上阿留申群島的佯攻部隊調往中途島，而且將原本抵近在珍珠港一線的潛艇也派往中途島一線。反正現在美國艦隊已經離開了珍珠港。讓潛艇繼續留在珍珠港附近也沒有意義了。按照黑島龜人的設想。南云的機動部隊將和細萱戊子郎的第五艦隊匯合，集中四艘航空母艦再同美軍艦隊決一死戰！
應該說這個設想還是合理的，如果細萱戊子郎的艦隊能夠快速南下，如果南云忠一能和近藤信竹匯合，似乎日本人還有翻盤的可能性。甚至樂觀的黑島龜人還描繪出了如下的場景：殲滅美畜艦隊之后，由戰列艦將遭受重創大破的蒼龍號、加賀號和赤城號以及美畜的約克城號拖回本土修理，這樣一來，損失幾乎沒有了。還白賺一艘航母，斷然是一場“轟動”的大勝。
鬼子還真能想美事，但是不管是黑島龜人還是同意了這個建議的山本五六十其實都沒有意識到一點——今天的戰斗還沒結束呢！不管是飛龍號也好還是瑞鳳號也罷，并沒有脫離危險，它們依然在盟軍艦載機的打擊范圍之內，一旦這兩艘航母再完蛋了，哪怕是只損失一艘，黑島的那個翻盤計劃就要破產。
為什么這么說呢？原因很簡單，細萱戊子郎的第五艦隊的龍驤號、隼鷹號航母跟真正的艦隊航空母艦相比還是有較大差距的。龍驤號還好點，至少還是正兒八經的航空母艦。而隼鷹號可是用快速郵船改造出來的半路出家航母，作戰效能是要打折扣的。比如說隼鷹號的最大航速就只有25節左右。跟真正的艦隊航母還是差了不少的，如果要一起編隊行動，就得遷就它。
而且龍驤號、隼鷹號航母的艦載機數量偏少，比如說龍驤號載機在三十架左右，隼鷹號也只有五十架的水平，這兩艘航母加一塊也就只有八十架艦載機，而加賀號和赤城號都是擁有90架艦載機的大型航母，一艘就頂得上他們倆了。
這么算吧，此時還能作戰的飛龍號以及近藤信竹的瑞鳳號艦載機數量是少得可憐，隨著赤城號和加賀號的損失，絕大部分戰機都隨艦一起被摧毀，只有少數飛到了飛龍號上。而且隨著山口多聞下令兩次出擊，這些僅存的艦載機也在攻擊波中消耗得七七八八了。至于近藤信竹的瑞鳳號則更慘，一波流出去襲擊紅海軍結果完全是肉包子打狗，幾乎是一架飛機都沒有逃回來。
這么說吧，此時飛龍號和瑞鳳號其實就是個空殼子，光有航母沒有飛機。可能有同志要問了，既然只有航母沒有飛機，這還打個毛線，鬼子還是乘早洗洗睡吧，趕緊撤退說不定還能保住兩艘航母。留下來繼續戰斗恐怕是肉包子打狗啊！
不過黑島龜人不是這么想的，他認為完全可以一戰。他的設想是，角田覺治的第二機動部隊趕緊南下，而南云忠一的第一機動部隊和近藤信竹的航母則暫時北上，當雙方的距離縮短到艦載機的航程范圍之內時，隼鷹號和龍驤號起飛全部艦載機向南飛行，這正好就可以降落在飛龍號和瑞風號的甲板上。而飛龍號和瑞風號的任務就是給這批飛機加油掛彈，然后對美軍進行“意想不到”的打擊。
這么說吧，黑島龜人的戰術很像后來馬里亞納獵火雞中鬼子使用的穿越轟炸戰術。此時使用這種戰術可以縮短第二機動部隊南下的時間，可以讓第一機動部隊盡快恢復戰斗力。以隼鷹號和龍驤號上的八十多架艦載機，再加上飛龍號上的“存貨”，大概能湊個一百架，既然前頭山口多聞用拼湊出的十幾架飛機就能重創約克城，這回一百架飛機憑什么搞不定敵人剩下的兩艘航母呢？
對于黑島龜人的建議，山本五十六予以了部分采納，下午三點，大和號向各司令長官以及各站隊司令部下達了第一五五號作戰命令，其中山本首先向他們通報了主力艦隊的位置，然后說：“第二，中途島攻略部隊派部分艦只為運輸艦護航，同時暫向西北撤退。第三，第二機動部隊盡快與第一機動部隊匯合，并完成攻擊……，第四，潛艇陣位進行變動……”
就在山口多聞放飛第二波攻擊機群之后，南云忠一按照山本五十六的命令。要求其立刻向北全速撤退。要求其盡早脫離美國飛機的打擊范圍。
對山口多聞來說。執行這道命令多少有點不情不愿，為什么呢？因為在他看來航母怎么也跑不過飛機，就算飛龍號全速前進，一個小時也就是跑60公里的水平，而最慢的美國魚雷機一小時也能跑兩百公里，指望此時利用高速逃出敵人的打擊范圍是在是天真的想法。
更何況山口多聞一點都不想撤退，哪怕是暫時撤退他也不情愿，在他看來敵人遠遠沒有想象中那么強大。誠然敵人摧毀了赤城號、加賀號和蒼龍號。但是敵人艦載機的損失也是驚人，根據飛行員和炮手的報告，累計已經擊落超過三百架敵機（水分多多），而敵人的三艘航母攏共只有多少艦載機？
山口多聞認為美國人也沒有多少艦載機了，除去相當數量的戰斗機和中途島的轟炸機，能用來攻擊飛龍號的能有多少？也就是說，在他看來雙方的實力其實是半斤八兩，如果搏一把的話，飛龍號未嘗沒有單騎救主的可能。
所以，當時山口多聞是命令盡可能的搜集攻擊機。努力地拼湊力量，是準備用第三波進攻決一勝負。自然的。此時南云忠一命令他撤退，肯定不太高興。
不過這道命令是山本五十六下的，哪怕是山口多聞一肚子都是意見也不得不執行（他和山本私交相當的好）。當然我們知道山口多聞的估算是有錯誤的，他少算了紅海軍特混艦隊的那兩艘航母，除去擊落三百架敵機中的水分以及紅海軍的ro2和中途島的tbd和sbd，實際上美國航母上損失比較大的是魚雷機，而俯沖轟炸機完全可以一戰。
也就是說，山口多聞留在原地根本就是死路一條，這一次山本五十六和南云忠一是對的，他有些想當然了。實際上更想當然還在后面，當飛龍號高速向北撤退的時候，橋本完成對約克城的第二次打擊之后向他報告：“摧毀敵航母一艘！”
不管是已經撞向了約克城的友永還是活著的橋本都搞錯了一件事，那就是錯誤的將約克城號當成了其姊妹艦，以為攻擊的是一艘全新的美國航母。當然，這也主要歸功于約克城號官兵優異的搶修能力，誰能想到這是一艘幾個小時前剛剛遭受重創的航母呢？
當這個消息傳到山口多聞耳朵里時，這位性急的海軍少將是懊悔不已，他認為自己錯過了一次翻盤的絕佳機會，按照他的算法，此時在中途島敵我實力對比是一比一了，飛龍號完全可以創造奇跡嘛！
山口多聞急不可耐地就將這個好消息傳給了南云忠一，再一次請求轉舵，回去同美國人決一死戰。那南云忠一是什么反應呢？對于能摧毀第二艘美國航母，南云自然感到高興，這多少也挽回了他的面子。但是對于轉舵回去繼續作戰，他心存顧慮：
“我艦隊艦載機所剩無幾，如何一戰？萬一飛龍號再有損失，如何向天皇陛下交代？”
所以南云忠一斷然拒絕了山口多聞的要求，命令這個有些越來越不安分和傲氣的部下執行聯合艦隊司令長官的命令。這給山口多聞氣得夠嗆，實話實說，此時的山口確實有點翹尾巴了，他認為是他挽回了敗局，如果沒有他果斷下令反擊，此時第一機動部隊恐怕已經全軍覆沒了，哪里輪到南云忠一繼續拿著雞毛當令箭。
所以山口多聞干了一件有點出格的事情，那就是越級向山本五十六打小報告，希望這位摯友能同意他的繼續作戰的請求。
可想而知，當山本五十六收到這封電報時，表情會是多么精彩，一方面他很高興飛龍號在危機關頭敢打敢拼的精神，能夠在極端困難的情況下摧毀敵人兩艘航母。這確實不容易，而且這也為艦隊保住了翻盤的希望。但是山口多聞越級打小報告的行為在上尊下卑等級森嚴的日本海軍中屬于相當冒失和不能容忍的行為，哪怕是山口多聞一心為國，這樣的行為也是不可取的。就是山本五十六也很不喜歡這樣的行為。
最后，也是最關鍵的一點，山本五十六也不同意山口多聞的冒險行動。如果飛龍號繼續留在戰場上。那么很有可能立刻會遭到美國人的襲擊。能不能生存下來真心是不好說，與其冒險當孤膽英雄，還不如等近藤信竹匯合，然后利用龍驤號和隼鷹號上的艦載機進行反擊，這樣把握更大而且風險更小。
所以山本五十六斷然拒絕了山口多聞的建議，命令他“堅定不移”地執行既定方針。可想而知，山口多聞收到這封電報時將是多么失望。不過胳膊扭不過大腿，他除了執行命令別無他法。
和歷史上相比。此時的情況就變得有所不同了，山口多聞高速撤退，險之又險的避開了企業號和大黃蜂號對它的第二次打擊，算是暫時保住了一條小命，但是戰斗并沒有結束，在這個晚上和第二天早上，最終回合的較量將決定一切。
雙方都在積蓄力量，等待著最后的決戰。對于日本人來說，這將是他們最后的翻盤機會。作為第一機動部隊指揮官，南云忠一的狀態就顯得尤為重要了。
白天的打擊對來南云忠一來說確實很要命。不過當他踏上熟悉和深愛的巡洋艦甲板（他是水雷戰隊出身），以及接到山本五十六的命令之后。他就像一棵即將枯死的小草陡然迎來了甘霖，頓時又恢復了生機。
為了迎接最后的決戰，南云忠一將能派出去的偵察機全部都派出去了，以至于整個下午以及晚上，各偵察機的報告雪片似的涌入他的司令部。而這些偵察報告并一定都是準確的，相當一部分是錯漏百出和撲朔迷離。
不過在這些亂得可怕的情報中，南云還是獲得了機幾份關鍵的情報，如果他對這幾份情報引起了重視，那他和山本后來也不至于陷入一團混亂的局面，更不用在慘敗之后憤憤不平和耿耿于懷了。
第一份報告是關于美軍艦隊的，提到了通過俘虜的美國落水飛行員搞到的美國艦隊組成情況，核心是闡明了有三艘航母，分別是約克城號、企業號和大黃蜂號。
看上去這份報告平淡無奇，但是還是相當有意義的，因為這份報告告訴了南云忠一美國艦隊的組成。
第二份報告就更有意思了，因為這份報告是來自于飛龍號的飛行員，參與了兩波次進攻的飛行員回憶他們攻擊的航空母艦時回憶道：
“敵艦似乎遭受過攻擊，甲板及煙囪部位有損傷。”
這一條情報其實是直接指出了飛龍號兩次攻擊的是同一目標，但是這個關鍵情報被否決了，不管是山口多聞還是南云忠一都一廂情愿的相信他們摧毀了兩艘美國航母。
第三條情報是近藤信竹的九五式水偵發回來的，這架勇敢的偵察機在黃昏時分接近了紅海軍特混艦隊，觀察到敵人有兩艘航空母艦在并排高速向北航行。
這一條情報依然被忽視了，因為日本人認為飛行員一定是看錯了，首先在那個海域就不可能有美國航母，更不可能有兩艘，估計是飛行員將貨輪之類的誤認為是航母了。
其實后兩條情報是非常關鍵的，如果南云忠一和山本五十六引起了重視，認真的再次去偵察一下，恐怕不難發現他們之前的判斷是錯的離譜。盟軍還擁有四艘大型艦隊航母，第二天的海戰他們根本不可能獲勝。
不過這一切都沒關系了，因為日本人選擇了找死。在山本的命令下，聯合艦隊各部在互相聯絡的同時，沖破黑色的濃霧開足馬力向戰場駛去。
宇垣纏在大和號艦橋上不斷與指揮室的山本和其他作戰參謀取得聯系，同時指揮著艦隊航行。不過濃霧卻給日本主力艦隊造成了不少麻煩，在編隊尾部航行的長門號在一個小時后才接到命令，只能盡全力地追趕艦隊主力。這讓宇垣纏和山本五十六相當的不滿，不過說實話，在當時那種天氣條件下，連信號燈都看不到，出現失誤是可以理解的。
和艦隊主力相比，南云忠一的機動部隊頭頂也籠罩著一層人為制造的迷霧。榛名號的偵察機向南云忠一報告：“敵方位80度，距離九十海里。由五艘大型巡洋艦和一艘正在猛烈燃燒的航母組成。”這個情報除了五艘巡洋艦比較扯淡之外，大體還是準確的，但是僅僅過了十分鐘榛名號的偵察機又報告：“敵方位90度，由五艘大型巡洋艦和五艘航空母艦組成，敵航母正在燃燒。”
這簡直讓南云忠一要抓狂。尼瑪，一杯茶的功夫敵航母就從一艘變成了五艘，你丫以為這是變戲法啊！正是因為偵察報告錯漏百出和莫名其妙，這讓南云忠一選擇性的將這些“胡言亂語”全都過濾掉了，他老老實實的按照山本的要求準備迎接龍驤號和隼鷹號的艦載機……(
