綾波麗并不理解眼下安排的訓練對自己有什么意義，她被要求和碇真嗣以及他們的同學們一起去參觀海洋博物館。
那里現在是由加持良治這個超級多面間諜負責，也是人類如今為數不多的還能夠看到第二次沖擊之前的海洋動物的地方。
血紅色的海洋中，已經幾乎沒有任何生物了，而海洋生物博物館中，則通過某些設備將海水重新還原成了原本藍色的大海的樣子，并且在其中養殖了許多幾乎滅絕的野生動物。
參觀這種地方，為了保證人類身上攜帶的病毒，細菌，并不會對這些野生動物造成影響，需要經歷一次又一次的清洗，被泡在各種各樣的消毒液之中，一群少年少女只穿著內衣在這樣的環境之中坦誠相見。
一開始還有些羞澀，等到洗刷的多了，一個個全都是生無可戀的表情，等到最后換上了一身制服，終于可以參觀這些海洋生物的時候，許多人臉上都是生無可戀的表情。
“大叔太狡猾了，明知道進這里需要經歷那么多消毒步驟，竟然提前一步偷偷進來了！”明日香的氣憤很快就被打消掉，因為她看到了曾經前所未見的動物，那現在海洋中游泳的熱帶魚類，生活在原本的南極的企鵝，水下世界的色彩繽紛，完全超乎了她的想象，生活在這個年代的人，是幾乎不可能見到這番光景的，不由得讓人懷念大滅絕之前。
加持良治作為多面間諜和泡妞高手，長得帥又溫柔的性格，頓時讓明日香被深深吸引，就差淪為迷妹了。
TV版中，明日香就是加持良治的迷妹，看樣子眼前這一次也是逃不掉了。
“在這里好幾種生物能被你們看到，還要感謝這個自然物種修復基金會，人類在南極和北極都是有地球物種基因庫建立的，因此許多滅絕的動物的基因還是保留著的。
但光有基因，沒有母體，只有一些植物和卵生的動物比較容易復活過來，另外那些更為復雜的動物，以人類現有的技術手段是很難進行繁育的，而自然物種修復基金會就致力于這一點。
這里大半的動物都是他們幫忙修復的。”加持良治說著，還將相關的資料投影到屏幕之上，對這些東西，幾個孩子并不是很感興趣，只是想要去下一個場館參觀新的動物。
唯獨碇真嗣在看到眼前的場景之后，略微皺起了眉頭，他在那段有關于自然物種修復基金會的視頻之中，看到了幾個熟悉的身影，那些似乎都是藍諾，雖然相貌上或多或少會有些區別，但神態和動作都很相似，特別是那些相貌差異很大的人，同樣擁有相同的神態和動作，就比較不可思議了。
“嗯……大叔你也是克隆體嗎？”碇真嗣突然開口詢問，如今的他既然可以調查nerv，自然也可以調查藍諾背后的組織。
“嗯？有進步啊，已經開始找機會試探我的情報了，不過想把我的秘密挖出來，你小子還嫩得很呢。”藍諾雖然并沒有正面回答，但碇真嗣心中似乎已經有了答案。
這個自然物種修復基金會之中，恐怕有不少的成員都和藍諾有千絲萬縷的聯系，正常情況下能夠擁有如此強大行動力，知道如此多秘密的人，背后也定然有一個屬于他的組織。
相比于碇真嗣出來參觀游玩都會想這么多事情，其他人就顯得純粹多了，純粹是來玩的，綾波麗在這個過程中顯得有些格格不入，她看著那些玻璃池水的海洋生物：“他們離開了維持生命的水池，就無法繼續生存，就像我一樣。”
這話大概也只有三位駕駛員彼此之間明白什么意思，明日香猶豫了一下，但還是上前推了她的肩膀一下：“別那么悲觀，你的身體不是已經比之前好不少了嗎？慢慢調理，遲早可以實現獨立生存的。”
綾波麗看向明日香的方向，這種被關心的感覺，讓她體驗非常奇妙。
“別那么看著我啊！我是看那個笨蛋反應實在是太慢了，這才替他過來安慰你的，啊！你那是什么眼神啊？太奇怪了！”
碇真嗣也走上前，毫無違和感的牽起兩人的手：“不論是人類的未來，災難的真相，還是我們每一個人的夢想。我都會和你們一同背負。”
加持良治看到這一幕湊到藍諾耳邊小聲道：“這孩子很有天賦嘛，無師自通呦～
在泡妞這一點上，我唯一承認比我更強的就是司令，看起來這孩子也繼承了這一點呢！”
“確實！”藍諾點點頭：“這時候就該說你們都是我的翅膀了！”
“混蛋！你們兩個惡心的中年男人在那里嘀嘀咕咕什么呢！”不遠處明日香的怒吼聲傳來，作文已經解開了一階基因鎖的存在，聽力可不是尋常人能比。
一陣雞飛狗跳之后，眾人好不容易收拾好現場，然后就是碇真嗣的裝逼時間了，強大的烹飪技巧是每一個亞撒西男主的必備技能，碇真嗣也是如此，特別是在解開了三階基因鎖后，對于細節的掌控已經達到了一種匪夷所思的程度，雖然做的只是看起來普通的便當，但打開的時候甚至讓人產生了一種會發光一般的錯覺。
“嘶……太夸張了吧！這家伙作弊啊，是不是在料理中下藥了？”在一起邀請過來的鈴原冬二嘴上說著做飯，這種事情不該是男人做，但卻已經吃的淚流滿面，感動的淚水從嘴角瘋狂的流淌下來，吃完自己的一份，就盯著其他人的看。
綾波麗本來是并不吃肉的，即便是人造肉大多數時候也是不會吃的，但面對這似乎是下了藥的料理，也被徹底征服了。
藍諾面無表情的扒飯，表示自己一點都不羨慕，做飯這種東西是一種天賦，藍諾現在就算是已經到了四階，做出來的菜對大多數人來說也只能算得上是好吃，完全達不到這種下了藥一般的效果。
面對天賦異稟的碇真嗣，只能自我安慰，表示自己這方面的天賦全都點在災后重建的時候，怎么把有機物合成工廠中的有機物塊，蟲子和蘑菇做的好吃上面了。
這大概是使徒來襲后，幾位駕駛員們所經歷的最輕松愉快的一段時光了，碇真嗣和明日香在這次游玩結束后，明顯能夠感受到，綾波麗似乎出現了某些變化，最直觀的體現大概就是比之前更像一個活生生的人了。
而在這些變化出現的同時，感覺更加敏銳的碇真嗣，更是從對方的身上感覺到了一種讓自己都感覺到無比危險的氣息，并不是說綾波麗對他有什么敵意，而是一種天然的位階上的壓制，是四階對于三階的天然壓制。
藍諾其實也能夠表現出來這種壓制力，只不過他對自己的力量掌控的很好，從一開始的基礎打的就非常的牢靠，所以可以完全收斂出這種氣勢，但綾波麗卻不行，隨著她人性一面的覺醒，屬于神性那一面的力量開始逐漸能夠被她所掌握，她也就可以一定程度的調動出四階的力量，雖然只是微不足道的一點，但也足以讓她在作為駕駛員的時候發揮的比以前更強的多，碇真嗣感受到的也是這一點神性的氣息。
“今晚回去好好休息吧，明天你們就該忙起來了。”在告別的時候，藍諾對三人做出了提醒。
碇真嗣和明日香回到家之后，一時之間卻有些睡不著，兩人幾乎是不約而同的打開了隔在雙方房間之中的隔斷，兩人之間也只有那么一層薄薄的拉門。
“啊……”推開門就看到對方的臉，實在是把彼此嚇了一跳，不過很快，他們也從慌亂中冷靜下來，開始討論明天可能會來襲的使徒究竟是什么樣的？
“究竟是什么樣的使徒，連現在的你都難以對付？”明日香在經歷了一次又一次作死一般的特訓之后，更加深刻的理解了現在的碇真嗣有多強，按理來說已經沒有什么使徒能夠拿到他們了。
“還是有一種可能的，那就是量變引起質變，使徒的體積不一定就和我們EVA的體積一樣，他可能比我們大很多，也可能無比微小，甚至如紅微生物一般。
他們能夠釋放出來的攻擊，如果在物理層面強大到一定程度的話，或許也能夠超出我們的對抗范圍。”
明日香點點頭：“你說的有道理，不過我覺得大叔似乎已經給了我們提示，在之前和我們的對話之中，其實已經提示了我們應該如何尋找線索。”
碇真嗣一時間還沒有想明白：“你說的是什么樣的提示？”
“還記得大叔之前提到陽電子炮嗎？他當時非常詳細的給我們講述了這個例子，并且列舉了陽電子炮項目之中的諸多投資都是來自于seele，而這些項目針對的就是那種EVA通過常規手段無法打敗的使徒。
你之前打敗的雷米爾就是一個很典型的存在，通過我們巨大的機體無法擊敗他，才有了擅長遠程攻擊的陽電子炮，按照那大叔所說的，我們接下來面對的是三人合力都難以應對的使徒，應該也是類似的存在。
那么既然拿到了死海文書的seele已經知道了人類將要面對一個難以抵抗的對手，我想應該投入大量的資源，來建設相應的專門針對對方的設施吧！我們或許可以從這方面入手，調查15年前，甚至是更久之前，第三新東京市投入建設過程中，有哪些獲得了他們重點投資的項目？”
碇真嗣眼前一亮：“對哦！還可以這樣，我之前怎么沒有想到？”
碇真嗣立刻把自己的手提電腦拿了出來，連接到網絡之中后，開始飛快的調取市政系統中的數據，相比于三賢人系統，市政系統的防御強度在他面前幾乎就等同于不設防，很快，市政系統建設之中各項項目的投資方就已經被調了出來。
大多數的資金來源都是政府方面和其他國家的援助，但其中一部分設施，那個時候特別要求建設，其中包括了陽電子炮，除此之外還有另外一些，其中最可疑的就是城市升降系統·改。
這個系統要求城市可以快速升降，并且整個地面都可以升降，不只是地面上的大樓。
也就是說地面可以升起，變成一個斜面，而從這些斜面的建設來看，他們的目的是在城市之中構建出一個又一個弧形，這些弧形軌道看起來就像是跑道一般，構成了一個又一個碗一樣的形狀。
而他們則可以調整角度，調整這些弧度出現的位置。
“你覺得這些東西像是用來干嘛的？”明日香看了半天沒想明白這些將城市的地面支撐起來的設施有什么用。
碇真嗣在看了一會兒之后，用自己的電腦進行了建模，構建起了一個虛擬地圖：“你看如果把他們整齊的排列起來，像不像是給我們的EVA用來強制轉彎的弧形坡道，在這種弧形跑道之上，我們可以用很小的半徑，極高的速度進行轉彎，這意味著在接下來的戰斗之中，我們或許需要追逐什么東西，下一個使徒或許是速度很快，又或許是它會出現在不確定的地點，需要我們的快速奔跑，來確定它的位置，并且對他進行擊殺。”
明日香點點頭：“很有可能，一種可能是這個使徒擁有空間轉移的能力，可以出現在城市各種各樣的地方。”
“不，這種可能性很小，如果使圖有空間轉移的能力的話，最大的可能就是直接空間轉移，讓自己出現在最終教條之中，在城市表面設計這些防御設施根本沒有意義。
我傾向于使徒可能是從天而降，而我們的雷達系統會受到干擾，無法判斷他的落點，所以需要我們有快速轉移的能力。
不過不管是哪種可能，接下來這場戰斗最為重要的就是速度，我們現在能做準備的，就是盡可能的想辦法提高我們的機動力，我預設了一種用at力場構建的航空發動機結構，我把圖紙在電腦上展現出來，你盡可能的把這個結構記住，如果你的at力場控制能力不夠的話，我這邊還有結構相對更簡單一些的設計，用我們機體的血液就可以作為燃料。”
