且說方臘親至，大元軍和永樂軍即將展開最后的決戰。
雖然已經到了窮途末路，可方臘仍舊心氣不失，他當即就要遣方杰出戰，還想要成為主動出擊那一方。
大元軍這邊，石寶、魯智深等人也在商量，準備派杜壆出手，一舉拿下實力不弱的方杰。
就在這時，永樂軍方面，只聽得飛馬報道：“御林都教師賀從龍總督軍馬去救歙州，被大元軍大將盧俊義活捉過陣去了。軍馬俱已漫散，大元軍已殺到山后。”
方臘聽了大驚，急傳圣旨，便教收軍，且保大內。
當下方杰殿后，方臘罷戰，御駕回至清溪州界。
可這時，只聽得大內城中喊起連天，火光遍滿，兵馬交加。
卻是石秀、張順等在清溪城里放起火來。
方臘見了，大驅御林軍馬，入城混戰。
石寶等見永樂軍退去，知道必是韓世忠率軍來合圍以及石秀、張順等建功了，緊隨其后追殺。
趕到清溪，見城中火起，石寶急令眾將招起軍馬，分頭殺將入去。
不多時，韓世忠等也殺過山來，兩下接應，化做一路。
四面全是大元軍，夾攻打清溪大內。
永樂軍哪里能敵，只能敗走。
大元諸將，四面八方殺將入去，各自去搜捉永樂軍，打破了清溪城郭。
方臘得方杰引軍保駕防護，率領十幾萬精銳，撤到幫源峒中。
大元軍的大隊軍馬，很快就全都殺入清溪縣來。
眾將殺入方臘宮中，收拾違禁器仗，靈器、靈石，搜檢內里庫藏，然后就殿上放起火來，把方臘內外宮殿盡皆燒毀，府庫錢糧，搜索一空。
石寶親自率主力大軍屯駐在清溪縣內善后，讓魯智深、韓世忠各率人馬直抵幫源峒口圍住。
且說方臘只得方杰保駕，走到幫源峒口大內，屯駐人馬，堅守峒口，不出迎敵。
魯智深、韓世忠把軍馬周回圍住了幫源峒，卻無計可入。
卻說方臘在幫源峒如坐針氈，亦無計可施。
不得已之下，方臘決定跟大元軍殊死一戰。
方臘以永樂軍精銳離開幫源峒再一次向大元軍發起進攻。
摩尼教的教眾再次吟頌起他們的圣歌：“焚我殘軀，熊熊圣火。生亦何歡，死亦何苦？為善除惡，唯光明故。喜樂悲愁，皆歸塵土。憐我世人，憂患實多……”
伴隨著圣歌，這些摩尼教教徒，不顧傷亡，用密集的隊形沖向大元軍，兩方展開了最血腥的廝殺。
如今還在方臘身邊的永樂軍，大多都是摩尼教的死忠，他們悍不畏死，給大元軍造成了巨大的傷亡，甚至一度差點撕開了大元軍的陣型。
暮靄沉沉，天色已晚，可狂熱的摩尼教教徒仍在瘋狂的進攻。
魯智深和韓世忠（尤其是后者）見此，沉著冷靜的利用騎兵機動性強的優勢，改變硬攻正面的戰術，分為東西二陣，魯智深指揮東陣，韓世忠指揮西陣，利用騎兵急馳，不斷改變東西兩側的兵力配備，一會兒集中兵力攻東，一會兒集中兵力攻西，一會兒又東西分兵同時進攻。
戰術節奏的變化，使得永樂軍來回奔跑不迭，一會兒援東，一會兒援西，十分疲憊。
最后，大元軍以付出了不小的代價打退了永樂軍的進攻。
轉天。
永樂軍由于兵力消耗太大，將士也全都因為前日的大戰疲憊不堪，而躲在幫源峒中沒有再向大元軍發起進攻。
大元軍也借此機會舔舐自己已經露骨的傷口。
又過一日，激戰再起。
這回，魯智深和韓世忠總結上次戰斗的經驗教訓，覺得不能再跟悍不畏死的永樂軍硬碰硬了。
——這樣下去，哪怕大元軍贏了，也得付出不小的代價。
永樂軍的戰術還是沒有發生改變，依舊是使用他們最擅長的人海戰術。
可大元軍卻在韓世忠的指揮下，改為發揮騎兵和地利的優勢，不再正面決戰，而是主要以游斗和靠著神臂弓、床弩、投石機來遠程射殺永樂軍。
這種很難碰到敵人、很難跟敵人正面廝殺的打法，讓永樂軍非常不適應，關鍵拼裝備他們實在是拼不過糧草輜重充足的大元軍。
沒辦法，方臘只能指揮永樂軍，不畏生死的往大元軍的營地里沖，尋求直接拼殺的機會。
可一直打到晚上，永樂軍都沒怎么有跟大元軍正面廝殺的機會。
兩天的激戰，由于永樂軍只會一味的猛攻，這使得永樂軍的傷亡非常大，尤其是今天的進攻，不僅傷亡巨大，還沒有任何建功，甚至就連鄭魔王等大將都戰死了，進而導致大量的永樂軍的將士喪失了斗志，天一黑，就開始有永樂軍的將士成百上千的逃跑。
時遷派出的走報機密特種營的將士探明了這一情況，并及時將消息報告給了魯智深、韓世忠。
韓世忠敏銳的把握住了戰機，下達了將永樂軍徹底擊潰的作戰命令。
入夜，大元軍死士潛入永樂軍的營寨，然后在寨后放火。
看到火光，大元軍擂鼓吶喊，全線出擊。
本來就已經在跑的永樂軍的將士，見此，跑得就更快了。
頃刻之間，永樂軍的大寨便被大元軍攻破，永樂軍的將士紛紛潰逃。
方臘見大勢已去，只得下令焚毀營寨，連夜逃回山上。
魯智深和韓世忠親自來到第一線指揮大元軍隨后掩殺，馬不停蹄地追擊永樂軍。
二人此刻的目的只有一個：不能給永樂軍喘息之機，必須窮追猛打，徹底擊潰、乃至消滅永樂軍！
永樂軍的將士丟盔卸甲，逃回幫源峒。
韓世忠事先安排的埋伏起來的武松、顏樹德、劉廣、解珍、解寶等將，見永樂軍逃來，一聲令下，伏兵四起。
永樂軍無心戀戰，只顧拼命奪路而逃。
在這場戰斗中，武松等軍斬首近萬級，生擒永樂軍將士七萬多人。
緊隨其后趕來的各支馬軍無心打掃戰場，踏著丟棄遍地的戰利品，下令士兵抄小路實行平行追擊。
很快，仗著馬軍的優勢，大元軍所部又抄到了永樂軍的前頭。
但是，面對著大群大群潰逃的永樂軍以及崎嶇的山路，大元軍雖然人馬眾多，卻也無力將其全部“吞”掉。
沒辦法，各支大元軍只能盡力掩殺，追敵百余里，一直追殺到天亮，戰馬再也跑不動了，才鳴金收兵……
轉天，有一個叫“方庚”的人前來求見，說能幫大元軍捉到方臘。
魯智深和韓世忠叫方庚過來。
方庚來了之后，對魯智深和韓世忠說，當初，方臘準備起義之時，被幫源峒里正方庚父方有常察知，方有常派二子方熊告官，方庚又把方臘禁閉糧倉中。方臘得脫，殺方庚一家四十二口而舉義，唯方庚越墻逃脫，指天說誓，必傾盡全力報仇雪恨。
如今，大元軍打來，方臘敗退，方庚所以前來投身軍前，原為向導。
方庚還表示，他已經收買了方臘的侄子方瓊，獲悉了方臘躲藏的山洞。
魯智深、韓世忠等大喜，分付諸將：“今日廝殺，非比他時，正在要緊之際。汝等軍將，各自用心擒獲賊首方臘，休得殺害。你眾軍士只看永樂軍陣上方瓊回馬引領，就便殺入洞中，并力追捉方臘，不可違誤。”
三軍諸將得令，各自磨拳擦掌，掣劍拔槍，都要活捉方臘，建功請賞。
不多時，大元軍諸將，都到幫源峒前，把軍馬擺開，列成陣勢。
只見永樂軍陣上，方瓊立在門旗之下，他還特意在頭上系了一根紅色的絲帶。
一同出戰的方庚，對魯智深、韓世忠等人言，系紅絲帶之人便是方瓊。
只見方杰，立馬橫戟，出來挑戰道：“大元狗賊，哪個出來送死？”
在這個當口，魯智深、韓世忠等人已經傳令下去，不要傷著頭系紅色絲帶之人，跟著他追殺。
見方杰出來搦戰，大元軍陣上，杜壆、盧俊義一塊出馬，兩人一個舞起丈八蛇矛、一個舞起銀鋼槍，來與方杰對敵。
三將交馬，戰不過十數合，方杰便被杜壆和盧俊義擊敗。
方杰見杜壆和盧俊義太過厲害，他一個都打不過，何況以一敵二？
方杰虛晃一戟，望本陣中便走。
花榮、龐萬春見了，同時張弓搭箭，全中方杰。
方杰應聲下馬。
永樂軍眾將，驚得呆了，各自逃生。
方瓊則趁此機會，引大元軍殺入洞中。
方臘領著內侍近臣，在幫源山頂上看見大元軍殺了方杰，三軍潰亂，情知事急，一腳踢翻了金交椅，便望深山中奔走。
大元軍分開五路，殺入洞中，爭捉方臘。
不想已被方臘逃去，只捉住一些內侍文官，繳獲了大量靈器、靈石。
大元軍大縱軍將入宮，搜尋方臘。
當日幫源峒中，殺的尸橫遍野，流血成渠，斬殺永樂軍七萬余級。
當下魯智深、韓世忠傳令，讓四下舉火，監臨燒毀宮殿，龍樓鳳閣，內苑深宮，珠軒翠屋，盡皆焚化。但見：
黑煙罩地，紅焰遮天。金釘朱戶灰飛，碧瓦雕檐影倒。三十六宮煨燼火，七十二苑坐飛灰。金殿平空，不見嵯峨氣象；玉階迸裂，全無錦繡花紋。金水河不見丹墀御道，午門前已無臣宰官僚。龍樓移上九重天，鳳閣盡歸南極院。
隨后魯智深、韓世忠等眾將，監看燒毀了幫源峒中宮殿器皿屋宇樓閣，引軍都來洞口屯駐，下了寨柵。
計點生擒人數，只有賊首方臘下落不明。
這時，石寶也來到了幫源峒。
得知戰況，石寶傳下將令，讓包括魯智深、韓世忠在內的所有軍將沿山搜捉。告示鄉民，但有人拿得方臘者，奏聞朝廷，高官任做；知而首者，隨即給賞。
卻說方臘從幫源峒山頂落路而走，忙忙似喪家之狗，急急如漏網之魚，便望深山曠野，透嶺穿林，脫了赭黃袍，丟去金花幞頭，脫下朝靴，穿上草履麻鞋，爬山奔走，要逃性命，連夜退過五座山頭，走到一處山凹邊。
這一日，方臘來到嵌在山凹里的一茅庵。
方臘肚中饑餓，卻待正要去茅庵內尋討些飯吃。
只見松樹背后，轉出一個胖大和尚來，一禪杖將已經餓得手軟腳軟的方臘打翻，取條捆靈索綁了。
這和尚不是別人，正是花和尚魯智深。
拿了方臘，魯智深將他帶到草庵中，取了些飯吃，然后將方臘押解出山來，正好迎著搜山的軍健，一同押解方臘，來見石寶。
一眾大元將士見捉住了方臘，大喜，都問：“大師，你是如何捉到這廝的？”
魯智深道：“灑家領兵去捉拿這廝，不想入亂山深處，迷蹤失徑，迤邐隨路尋去。正到曠野琳瑯山內，忽遇一個老僧，引領灑家到此處茅庵中，囑付道：‘柴米菜蔬都有，只在此間等候。但見個長大漢從松林深處來，你便捉住。’夜來望見山前火起，灑家看了一夜。又不知此間山徑路數是何處。今早正見這賊爬過山來，因此俺一禪杖打翻，就捉來綁了。不想正是方臘。”
石寶又問道：“那老僧今在何處？”
魯智深道：“那老僧自引灑家到茅庵里，分付了柴米出來，竟不知投何處去了。”
眾人都說：“那和尚眼見得是圣僧羅漢，如此顯靈。今大師成此大功，回京奏聞朝廷，可以還俗為官，在京師圖個蔭子封妻，光耀祖宗，報答父母劬勞之恩。”
眾人皆笑。
有人更是直言不諱，大師長子、次子皆已能從軍打仗了，他一個花和尚，還還什么俗，就這樣挺好。
隨后，眾人都點本部將佐，俱已數足，將方臘用陷車鎖上，解上南京，面見江鴻飛。
同時石寶、魯智深、韓世忠等催起三軍，帶領諸將，離了幫源峒，到了清溪縣。
吳用、孫靜知道，清溪縣是摩尼教的大本營，這里的人，差不多人人信奉摩尼教，大多都是摩尼教的死忠，必須施展雷霆重手，永絕后患。
在這兩個心黑、手黑之人的主持下，清溪縣這里人頭滾滾、鮮血將這里的清溪都染成了血紅色。
早有神行太保戴宗將捉到方臘的消息、徹底消滅了永樂朝的消息報告給了江鴻飛。
雖說江鴻飛早就知道了，自己肯定能消滅方臘，完成大一統。
可是現如今，自己真的成為大一統的皇帝，江鴻飛還是覺得有些如夢似幻……
